Музей является структурным подразделением Института прикладной экологии Севера Академии наук Республики Саха (Якутия).
Музей создан в 1991 г. по постановлению Правительства Республики Саха как научный и культурный центр по изучению фауны млекопитающих и среды её обитания. Основы коллекции составляют находки, сделанные сотрудниками музея во время экспедиций.
В задачи музея входит сбор и систематизация в единой коллекции уникальных палеонтологических находок, их изучение, а также музейная деятельность.
Общее число единиц хранения – более 1000.
Общая площадь музея – 400 м2, под экспозицией – 310 м2.
В музее демонстрируются экспонаты по мамонтам и мамонтовой фауне – скелеты мамонта, шерстистого носорога, бизона, сайгака; костные и трупные останки различных животных ледникового периода; гербарий из кормовых трав, остатки которых найдены в желудочно-кишечном тракте мамонта и т.д. К уникальным находкам относятся куски кожи мамонта с глазницей и остатками хобота, а также хорошо сохранившаяся часть передней ноги древнего исполина.
Основные темы экспозиции:
· история изучения мамонтовой фауны;
· условия обитания мамонтовой фауны;
· мамонты;
· сопутствующая мамонтовая фауна;
· мамонт и человек;
· международные экспедиции Музея мамонта.
В музее составлен кадастр месторождений мамонтовой фауны, ведутся работы по ситематике, изучению изменчивости и эволюции млекопитающих Якутии.