Музей основан в 1939 году, когда была собрана первая коллекция горных пород, руд по Северо-Востоку России. Экспозиция музея отражает историю освоения, геологию и полезные ископаемые этого края.
Общее число единиц хранения – 5500 экспонатов, в экспозиции – 2500.
Общая площадь музея – 312 м2, под экспозицией – 282 м2.
Основные темы экспозиции:
· геологическое строение Северо-Востока России (Восточная Якутия, Чукотка, Магаданская область);
· месторождение цветных металлов;
· месторождение благородных металлов;
· золото и серебро из месторождений Колымы и Чукотки;
· цветные камни.
В музее представлены уникальные экспонаты – это достаточно полная коллекция самородного золота из коренных россыпей месторождений области и сопредельных районов (мелкие самородки, кристаллы золота, характерные и парагенетические ассоциации различных генетических и промышленных типов месторождений), небольшая коллекция самородного серебра из коренных и россыпных месторождений Дуката и Омолона, коллекция четвертичной ископаемой фауны, коллекция цветных камней.
В музее имеется шлифотека. В обменном фонде представлены образцы золотосеребряных месторождений, фауна юрского периода, цветные камни.